La Tercera Comisión Nacional de Seguimiento al Plan Nacional Decenal de Educación 2006 - 2016 es una instancia de carácter autónoma e independiente, integrada por 25 miembros, de los cuales 13 son representantes de las Comisiones Territoriales de Seguimiento al PNDE, y 12 provenientes de la II Comisión.

El proceso de la conformación de la III Comisión Nacional se inició en agosto de 2012 cuando la señora Ministra expidió la Circular No. 21, mediante la cual se exhortó a los secretarios de educación de las 94 ETC a conformar las respectivas comisiones territoriales, y se indicaban los requisitos para sus integrantes. La Gerencia del Plan Decenal efectuó la gestión para la conformación de las comisiones territoriales. La vigencia será de tres años, esto es hasta finales del 2015